Deze kerk werd in 1491 gebouwd om te dienen als slotkerk voor Schloss Augustusburg van de vorst-aartsbisschop van Keulen, waarbij de Francisckanen de diensten moesten verzorgen. Daarom is deze kerk genoemd naar de hoofdkerk van de Franciscanen in Assisi. Tussen het paleis en de kerk loopt een overdekte gang, zoals de gang van het Uffizi paleis over de Ponte Vecchio in Florence, waarvandaan de preekstoel kan worden bereikt. De huidige barokke preekstoel van 1737 toont taferelen uit het leven van Franciscus.